Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKD1Q969G9 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NKD1Q969G9 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.3 ms