Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
MCOLN3Q8TDD5 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms