Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PIK3C3Q8NEB9 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
PIK3C3Q8NEB9 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.3 ms