Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6U2

LINC00612, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00612, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00612Q8N6U2 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
LINC00612Q8N6U2 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
LINC00612Q8N6U2 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms