Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CLDN19Q8N6F1 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms