Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU1

IGDCC3, Immunoglobulin superfamily DCC subclass member 3, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGDCC3Q8IVU1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
IGDCC3Q8IVU1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms