Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AGBL3-202ENST00000435976 2495 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
KHDC3LQ587J8 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
KHDC3LQ587J8 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms