Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 KCNN1-201ENST00000222249 3625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 UGT1A3-201ENST00000482026 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF843-202ENST00000564218 3816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 VAX1-201ENST00000277905 4494 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 DGKA-202ENST00000394147 2770 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC102953.2-201ENST00000609755 3026 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ENKUR-202ENST00000376363 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TJAP1-201ENST00000259751 2720 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLC44A4-203ENST00000375562 2505 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.79□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms