Protein–RNA interactions for Protein: Q53GG5

PDLIM3, PDZ and LIM domain protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM3Q53GG5 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
PDLIM3Q53GG5 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
PDLIM3Q53GG5 MEGF11-203ENST00000409699 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
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