Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
TWISTNBQ3B726 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms