Protein–RNA interactions for Protein: Q309B1

TRIM16L, Tripartite motif-containing protein 16-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM16LQ309B1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 AMMECR1-203ENST00000372059 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
TRIM16LQ309B1 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC079447.1-201ENST00000424491 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ARID4B-201ENST00000264183 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ADPRHL1-204ENST00000612156 9759 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SYN2-205ENST00000620175 3871 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 GAK-214ENST00000511163 4280 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 DCUN1D2-201ENST00000332592 2626 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
TRIM16LQ309B1 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms