Protein–RNA interactions for Protein: Q16877

PFKFB4, 6-phosphofructo-2-kinase/fructose-2,6-bisphosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFKFB4Q16877 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFKFB4Q16877 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFKFB4Q16877 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PFKFB4Q16877 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFKFB4Q16877 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PFKFB4Q16877 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
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PFKFB4Q16877 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
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PFKFB4Q16877 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PFKFB4Q16877 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PFKFB4Q16877 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PFKFB4Q16877 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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PFKFB4Q16877 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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