Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RTN1Q16799 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
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