Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 UBTF-204ENST00000436088 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CLPPQ16740 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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