Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CDKN3Q16667 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
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