Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
ACKR1Q16570 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 874 ms