Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SYPL1Q16563 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
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