Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
PCSK7Q16549 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
PCSK7Q16549 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.7 ms