Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
EFNB3Q15768 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms