Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
PCOLCEQ15113 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.5 ms