Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
PCLAFQ15004 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms