Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC105105.3-201ENST00000585470 646 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC020914.3-201ENST00000594712 304 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
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CHD4Q14839 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 HIST1H2AH-201ENST00000377459 387 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CHD4Q14839 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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