Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
SPIDRQ14159 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
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