Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
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HDAC1Q13547 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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HDAC1Q13547 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
HDAC1Q13547 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
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