Protein–RNA interactions for Protein: Q13488

TCIRG1, V-type proton ATPase 116 kDa subunit a isoform 3, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCIRG1Q13488 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MGME1-203ENST00000377710 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ERICH5-201ENST00000318528 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
TCIRG1Q13488 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
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