Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
TRAF1Q13077 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
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TRAF1Q13077 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
TRAF1Q13077 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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