Protein–RNA interactions for Protein: Q12974

PTP4A2, Protein tyrosine phosphatase type IVA 2, humanhuman

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Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A2Q12974 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
PTP4A2Q12974 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTP4A2Q12974 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
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