Protein–RNA interactions for Protein: Q12824

SMARCB1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily B member 1, humanhuman

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Length 385 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCB1Q12824 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AC105233.6-201ENST00000642093 218 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCB1Q12824 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
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