Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG06

FAAP100, Fanconi anemia core complex-associated protein 100, humanhuman

Predictions only

Length 881 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP100Q0VG06 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 PFAS-212ENST00000625942 396 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
FAAP100Q0VG06 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms