Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CGNL1Q0VF96 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms