Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 APOBEC3H-202ENST00000401756 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PDE4DQ08499 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.4 ms