Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PGAP2-209ENST00000464261 830 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CXCL9Q07325 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CXCL9Q07325 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms