Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CACNG1Q06432 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CACNG1Q06432 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms