Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC005154.1-201ENST00000434399 1217 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OR52A4P-202ENST00000481634 799 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 OR52A4P-203ENST00000498233 1014 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NSMCE2-206ENST00000519010 848 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NSMCE2-210ENST00000522563 1037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC134669.2-201ENST00000578584 1008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC069503.1-202ENST00000616576 642 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC138907.10-201ENST00000623708 983 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
TNP2Q05952 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MIRLET7DHG-201ENST00000416309 1294 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DSCR4-IT1-201ENST00000417138 424 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL645634.1-201ENST00000418426 462 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC022679.2-201ENST00000522186 813 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ZNF826P-202ENST00000542380 1067 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AC063944.3-201ENST00000609969 533 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
TNP2Q05952 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms