Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
UBXN1Q04323 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms