Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XPCQ01831 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XPCQ01831 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TUBB6-203ENST00000586653 788 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XPCQ01831 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
XPCQ01831 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms