Protein–RNA interactions for Protein: Q01094

E2F1, Transcription factor E2F1, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F1Q01094 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
E2F1Q01094 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
E2F1Q01094 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms