Protein–RNA interactions for Protein: Q00526

CDK3, Cyclin-dependent kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK3Q00526 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CDK3Q00526 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CDK3Q00526 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms