Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ZNF30-202ENST00000439785 2651 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms