Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LINC01248-201ENST00000458264 468 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
ERVK-21P61565 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
ERVK-21P61565 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms