Protein–RNA interactions for Protein: P61221

ABCE1, ATP-binding cassette sub-family E member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCE1P61221 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 GLS2-201ENST00000311966 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ABCE1P61221 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.9 ms