Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBASH3AP57075 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms