Protein–RNA interactions for Protein: P56746

CLDN15, Claudin-15, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN15P56746 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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CLDN15P56746 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CLDN15P56746 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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