Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ERFP50548 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 FKBP5-203ENST00000539068 3827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ERFP50548 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ERFP50548 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms