Protein–RNA interactions for Protein: P43304

GPD2, Glycerol-3-phosphate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 727 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPD2P43304 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPD2P43304 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPD2P43304 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPD2P43304 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPD2P43304 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GPD2P43304 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPD2P43304 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPD2P43304 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPD2P43304 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPD2P43304 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
GPD2P43304 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPD2P43304 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPD2P43304 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GPD2P43304 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms