Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
ITGAEP38570 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ITGAEP38570 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms