Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 FOXL1-201ENST00000320241 3655 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 RBPMS-202ENST00000320203 3110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
TGFBR1P36897 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms