Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
TRIM23P36406 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
TRIM23P36406 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms