Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CASP1P29466 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CASP1P29466 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP1P29466 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP1P29466 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CASP1P29466 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CASP1P29466 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms