Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
POLD1P28340 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLD1P28340 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLD1P28340 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
POLD1P28340 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
POLD1P28340 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
POLD1P28340 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
POLD1P28340 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms